Грисайя: Призрачный курок

После событий, описанных в "The Fruit of Grisaia", прошло несколько лет. Бывшая "Академия Михама", служившая убежищем для девушек, была переоборудована в учебное заведение SORD (Специальная организация по исследованиям и разработкам). Эта организация занимается подготовкой кадров для нужд национальной обороны. В академии обучаются несколько специалисток: Рена и Маки владеют огнестрельным оружием, Тока и Гуми являются снайперами, Крис отвечает за взрывчатку и обработку данных, а Мурасаки выполняет функции ниндзя для разведывательных операций.

Девушки совместно решают задачи, которые оказываются слишком сложными для полиции или Сил самообороны. Они неоднократно сталкиваются с опасными миссиями, требующими применения их навыков. Сюжет разворачивается вокруг их деятельности, связанной с применением оружия и выполнением боевых заданий. История повествует о группе молодых девушек, чья жизнь связана с кровью и порохом.